Budynek, w którym mieści się muzeum miejskie, należy do najstarszych w  mieście (pochodzi z ok. 1800 roku) i ma charakter klasycystycznej kamienicy w typie dworku. Cechy tego stylu przejawiają sią tutaj m.in. w zastosowaniu jońskich kolumn wspierających belkowanie i trójkątny przyczółek nad wejściem. W okresie międzywojennym, na parterze kamienicy, mieściła się popularna jadłodajnia państwa Banasiów, w której po śmierci matki, wraz ze swoim ojcem, stołował sie młody Karol Wojtyła.W latach osiemdziesiątych swoją siedzibę miało tu Towarzystwo Miłośników Ziemi Wadowickiej. W piwnicach mieściła  się galeria Biura Wystaw Artystycznych, a potem w pomieszczeniach na piętrze prezentowano ekspozycje historyczne  i artystyczne. Można było zobaczyć tutaj między innymi wystawę zbiorów Zygmunta Krausa poświęconą lotnikom amerykańskim zestrzelonym niedaleko Wadowic w 1944 roku.  

           

 Od 1 stycznia 1996 roku miasto zinstytucjonalizowało muzeum i powstały Zbiory Historyczne Ziemi Wadowickiej, prezentujące ekspozycję o amerykańskich lotnikach oraz wystawy przybliżające historię regionu. Przygotowywano także ekspozycje czasowe. W październiku 2000 roku w wyniku połączenia Wadowickiego Domu Kultury i   Zbiorów Historycznych powstało Wadowickie Centrum Kultury. Od tego czasu  muzeum działa w ramach tej instytucji.

 Od samego początku muzeum ma charakter historyczno-regionalny. Gromadzone zbiory dotyczą historii Wadowic i najbliższych okolic. W zbiorach muzeum miejskiego na szczególną uwagę zasługują: kolekcja kart pocztowych z widokami miasta z okresu galicyjskiego i międzywojennego, obrazy i rzeźby twórców związanych  z Wadowicami, dzieła twórców ludowych m. in. Wowry oraz prace młodych,  wadowickich artystów. Ponadto gromadzone są dokumenty, fotografie, pieczęcie, książki,  numizmaty i mapy związane z miastem.

 W 2009 roku została odnowiona elewacja budynku muzeum, konserwacji poddano m. in. drzwi wewnętrzne i główne wejściowe. Odtworzono przedwojenne boniowania, odrestaurowano balkony. Przywrócono budynkowi przedwojenny charakter.

Samorząd Województwa Małopolskiego w ramach realizacji zadania publicznego pod nazwą "Ochrona zabytków Małopolski" wsparł w roku 2009 remont budynku Zbiorów Historycznych w kwocie 40 000,00 zł.